熒光素是一種黃嘌呤染料，是生物學中常用的標記試劑。

水溶性熒光染料由于其分子半徑小，滲透性和血管灌注研究中得到應用。 以熒光素鈉作為熒光示蹤劑，用于研究血腦屏障(BBB)和血脊髓屏障(BSCB)在嚙齒類動物模型中的通透性。 以該染料為探針底物，研究了有機陰離子轉運多肽(OATP)介導的肝細胞藥物轉運。熒光素鈉還被應用于光致退色后 原位 溶質通過熒光恢復進入骨內。

熒光素鈉鹽被用作一種溶質，用于研究微血管滲透性。它已被用作研究血液屏障穿透性的測試分子。